根据目前的政策规定,农村学生医保卡一年的额度为人民币5000元。这个额度可以用于支付医疗费用,包括门诊、住院、手术等费用。农村学生医保卡的额度可以根据实际需要进行使用,但一旦超过额度,超出部分需要自费支付。因此,农村学生在使用医保卡时需要合理规划医疗费用,以充分利用医保卡的额度。